家蠶Bm1、BmSE轉座子對基因表達調控的研究.pdf

1、反轉錄轉座子作為基因表達的調控元件，對生物體基因組的進化有著非.常重要的作用。而在家蠶中，Bm1和BmSE轉座子是最主要的兩類短散列轉座子（Short interspersed Nuclear Elements，SINE）轉座子，其對基因表達的調控模式及其分子機制仍然不清楚。本文以綠.色熒光蛋白（Enhan.ced Green Fluores.cent Protein，EG.FP）基因為報告基因，考察和驗證了Bm1和BmSE轉座子對臨近

2、基因的調控模式，同時探究了轉座子調控基因表達的分子機制。主要結果如下：
　?、貰m1和BmSE轉座子對臨近基因的表達具有相同的調控模式：在基因上游的插入會導致基因表達的沉默，在基因下游的插入則不會沉默或者抑制基因的表達。而同時，這種調控模式具有跨細胞類型通用的性質，不僅在家蠶BmN細胞中發(fā)揮作用，在家蠶BmE細胞中也有同樣的調控效應，說明這種調控機制是保守性的。
　?、贐m1和BmSE轉座子沉默基因的表達需要滿足三個條件。1

3、）位置特異性：Bm1和BmSE轉座子僅在插入到EGFP基因上游時，才具有抑制作用；2）序列完整性：只有Bm1和BmSE轉座子具有完整的序列，才能夠保證抑制調控，任何破壞序列完整的處理，如截短、堿基突變都會解除沉默效應；3）方向正向性：Bm1和BmSE轉座子的沉默效應要求兩類轉座子正向的插入。
　?、跙m1和BmSE轉座子沉默基因的表達并不是在轉錄水平上發(fā)揮作用的，轉座子啟動子化、轉錄起始位點前移均未發(fā)生，同時轉座子的二級結構改變也

4、并不是影響基因表達的主要原因。
　?、芡ㄟ^生物信息學分析，我們得到了Bm1轉座子和BmSE轉座子在家蠶基因組中的分布，5’ UTR區(qū)域具有Bm1轉座子和BmSE轉座子正向插入的預測基因分別有125個和58個。
　?、萃瑫r根據8個家蠶和7個野桑蠶基因組重測序數據分析了Bm1和BmSE轉座子分別在家野蠶基因組中相應位點的插入頻率，插入頻率有明顯差異的位點共有51個，為理解家蠶馴化過程中轉座子的可能作用提供了有用信息。