肝癌轉移相關的蛋白質組學研究.pdf

1、。Y 9 5 二9 3 l梗宴父。。孥。， ／一博士學位論文肝癌轉移相關的蛋自質組學研究脘。 系：專 業(yè)：姓 名：指導教師：蠢。濺日期：化學系分析化學申華莉楊艽原教授2 0 0 6 年4 月1 0 日學校代碼： 1 0 2 4 6學 號：0 3 1 0 2 2 0 1 3復巨大學博士畢業(yè)論文D N A ／R N A 結合蛋白，h n R N P 蛋白，延長因子以及代謝相關蛋白，并對其中幾個h n R N P 家族蛋白進行了驗證。本論文由

2、四部分組成。第一章緒論首先概述了蛋白質組學作為一門新興學科，它的發(fā)展現(xiàn)狀和最新的技術進展，包括雙相凝膠電泳技術，生物質譜技術，色譜分離技術，蛋白質芯片技術，酵母雙雜交技術和串聯(lián)親和純化技術等。然后概述了肝蛋白質組研究的進展，提出本課題工作的研究方向。第二章所述工作采用雙相凝膠電泳和質譜聯(lián)用技術研究了純化的C 5 7 小鼠核蛋白的全表達譜。首先通過多次密度梯度離心分離得到純化的細胞核，通過電鏡照片和w e s t e r n - b l

3、o t 等方法驗證，證實了細胞核純度達到9 0 ％以上，保證了后續(xù)工作的意義。對提取的核蛋白分別應用非線性p H 3 ～1 0 ，和線性p H 4 ～7 ，長2 4 c m 的固定口H 梯度的I P G 膠條和1 2 ．5 ％的S D S —P A G E 進行雙相凝膠電泳分離總蛋白，得到的凝膠分別進行了銀染和考馬斯亮蘭染色。將所有膠上蛋白點切下進行膠內酶解，質譜鑒定。本工作成功鑒定了1 1 9 3 個鼠肝核蛋白，其中包括一些細胞定位不

4、明的蛋白( 4 0 ％) ，本工作為這些蛋白提供了可能的細胞定位。第二大類蛋白即為核蛋白( 2 0 ％) ，其它一些蛋白以前未被定位于細胞核的，本實驗的數(shù)據說明它們有可能共定位于細胞核。其中發(fā)現(xiàn)了很多D N 刪A 結合蛋自，參與核酸的調控和修飾等。在鑒定蛋白的同時，對鑒定結果進行了分析，發(fā)現(xiàn)了一些P M F 和串級質譜進行鑒定的矛盾信息，通過對這些信息的分析，一方面存在一些可能的蛋白質翻譯后修飾，另一方面也提示了目前檢索條件可能引入假陽

5、性鑒定的不足，提示我們在未來的研究工作中，若想得到高準確的鑒定，需要適當提高鑒定標準。第三章所述工作研究高轉移潛能的肝癌裸鼠模型L C I —D 2 0 的全蛋白表達譜。對組織蛋白進行一步提取和順序提取，得到的組分T o Ⅱe ，E l ，E 2 和E 3 分別用雙相凝膠電泳和多維液相色譜方法分離，然后進行質譜鑒定。共有9 9 5 個非冗余蛋白得到鑒定，其中發(fā)現(xiàn)了很多肝癌及肝癌轉移相關蛋白，包括常見的或文獻報道過的肝癌或轉移相關蛋白，如

6、甲胎蛋白，m s 蛋白，熱休克蛋白2 7 ，M A P K 蛋白等等；涉及了肝癌轉移的多個過程，如代謝，細胞運動和侵襲，信號轉導等，為全面、深刻的理解肝癌轉移這一復雜過程提供了豐富的數(shù)據。同時通過這一工作我們比較了各種分離技術以及蛋白提取方法。結果發(fā)現(xiàn)，根據蛋白質疏水性不同進行的順序提取可以大大增加蛋白的鑒定，而基于雙相凝膠電泳和液相色譜的分離手段則各有優(yōu)勢，互為補充?；谝合嗌V的分離可以避免對極端分子量和等電點蛋白的歧視，而雙相電泳