基于多種dna序列和cpssr的梨屬(pyrusl.)植物分子系統(tǒng)關系研究

1、浙江大學農(nóng)業(yè)與生物技術學院博士學位論文基于多種DNA序列和cpSSR的梨屬（Pyrus L.）植物分子系統(tǒng)關系研究姓名：鄭小艷申請學位級別：博士專業(yè)：果樹學指導教師：滕元文20080701浙江大學博士學位論文( 2 0 0 8 ) 摘要能序列和I T S 假基因序列的系統(tǒng)結構中，西方梨都為單源，與東方梨顯著分開，支持東西方梨為獨立分化的觀點．2 梨屬植物A d h 基因中存在長度各異的6 個內(nèi)含子區(qū)，我們僅對包括內(nèi)含子l 和內(nèi)含子2 區(qū)

2、的5 ’端6 5 0 b p 長的序列進行了分析．經(jīng)大量克隆測序發(fā)現(xiàn)，梨屬植物中至少存在4 種主要的A d h 位點：A d f i l ，A d h 2 、A d h 3 及A d h 4 和一種可疑的A d h 5 ．A d h 內(nèi)含子1 區(qū)長度變異較大，各A d h 位點在此區(qū)分別共享了其特有的長度變異．不同A d h 位點間的序列分化度較高，為8 ％．2 0 ％，而各位點內(nèi)的序列分化度也較低( Q ％) ．在大多數(shù)樣本個體內(nèi)，每

3、個不同A d h 位點都存在序列多態(tài)性，即存在多個同類A d h 拷貝。其中屬于A d h l 、A d h 2 和A d h 3 的差異拷貝大多為單源；而來自A d h 4 ( 拷貝數(shù)最多) 的個體內(nèi)差異拷貝大多數(shù)為多源，因此導出的系統(tǒng)樹結構與功能I T S 序列相似，關系復雜，可能存在譜系篩選及基源拷貝未鑒定準確的原因。四個位點中A d h 2 因起源較晚，拷貝數(shù)較單純，顯示了較好的應用價值。從系統(tǒng)樹結構和支持率看，低拷貝核基因初步

4、顯示了比功能性I T S 序列更好的系統(tǒng)學潛力3 兩個葉綠體非編碼區(qū)，t r n L 內(nèi)含子及t r n L ．F ，在梨屬植物中高度保守，未能預期解決梨屬內(nèi)系統(tǒng)關系．從系統(tǒng)樹結構看，東西方梨兩大組再次顯著分開，而西方梨樣本僅存在一種t r n L - F 序列的長度類型，多樣性簡單且與蘋果屬關系更近．而東方梨存在三種序列長度類型，多樣性較豐富．這兩個葉綠體非編碼區(qū)的長度突變和核苷酸突變?yōu)橐恍╇s種的母系提供了依據(jù)，如‘庫爾勒香梨’的母本

5、非西洋梨；褐梨、河北梨及部分秋子梨問關系密切；中國白梨品種并非起源于尸b r e t e s c h n e i d e r i l ( 罐梨) ，兩者不存在直接聯(lián)系．在東方梨中秋子梨顯示了最豐富的多樣性．4 應用1 2 對c p S S R 引物對供試梨樣本進行分析發(fā)現(xiàn)僅4 對引物的P C R 產(chǎn)物在梨屬中存在多態(tài)性。最后共獲得1 4 個多態(tài)位點，基于這些位點構建的U P G M A 系統(tǒng)樹結構與兩種葉綠體非編碼區(qū)序列的系統(tǒng)結果基本相